《九九九》的第三季以一场令人震惊的谋杀案拉开序幕,受害者是该市一位颇受欢迎的政治家。警探们迅速展开调查,并很快发现这起谋杀案与一个强大的犯罪集团有关。与此同时,警探们也面临着来自内部的压力,因为他们的局长正准备竞选下一任市长。
在调查过程中,警探们发现犯罪集团的触角已经渗透到了城市的各个角落,从政界到商界再到警界,无处不在。他们还发现,这个犯罪集团正在策划一项更大的阴谋,可能会对整个城市造成毁灭性的后果。
警探们必须与时间赛跑,在犯罪集团实施他们的计划之前阻止他们。他们必须克服重重困难,包括来自内部的背叛和外部的威胁。最终,他们成功地粉碎了犯罪集团的阴谋,并逮捕了幕后黑手。